'En büyük' mikrobiyom çalışması bağırsak sağlığımıza ağırlık veriyor
İnsan mikrobiyomunu araştıran en büyük çalışmanın ilk sonuçları geldi. Beslenme uygulamalarımız, antibiyotiklere direnç ve zihinsel sağlığımız için önemli çıkarımları var.
2012'de, California Üniversitesi'nden (UC) Rob Knight, Ph.D., San Diego, Ph.D., Human Food Project'in kurucusu ve Jack Gilbert, Ph.D. Illinois'deki Chicago Üniversitesi Mikrobiyom Merkezi'nin fakülte müdürü, Amerikan Bağırsak Projesi'ni kurmak için yola çıktı.
Projenin amacı, insan mikrobiyomu, yani tüm mikroplarımızı kodlayan genler koleksiyonu hakkında daha fazla şey öğrenmekti.
Özellikle, araştırmacılar vücudumuzda kaç bakteri türünün nerede yaşadığını ve diyetimizin ve yaşam tarzımızın bu mikropların bileşimini nasıl etkilediğini bilmek istediler.
Bu amaçla, vatandaş bilimini kullandılar - halkın zamanlarını ve kişisel verilerini analize sunarak araştırmaya katkıda bulunduğu uygulama.
Projenin ilk sonuçları artık mevcut ve bağırsaklarımızı sağlıklı ve bakteriyel olarak çeşitliliğin ne olduğu konusunda ipuçları sunuyorlar. Bulgular dergide yayınlandı mSystems.
Vatandaş bilim adamları mikrobiyomun incelenmesine yardımcı oluyor
Projenin bir parçası olarak katılımcılar, bakteri dışkı, ağız ve deri örneklerini toplayan bir kit için 99 $ ödedi.
Ayrıca genel sağlık durumları ve sahip olabilecekleri herhangi bir hastalık, yaşam tarzı ve beslenme uygulamaları hakkında soru soran bir ankete cevap vermek zorunda kaldılar.
2015 yılında proje, Amerika Birleşik Devletleri, Birleşik Krallık, Avustralya ve diğer 42 ülkede 11.336 kişi tarafından sağlanan 15.096 örnek saydı.
Araştırmacılar daha sonra, bakterilere özgü bir molekül olan 16S rRNA adlı bir genetik işaretleyiciyi analiz etmek için genomik sıralamayı kullandılar.
Ayrıca, mevcut olabilecek diğer molekülleri ve kimyasal bileşikleri analiz etmek için numunelerdeki metabolit setini de incelediler.
Son olarak, bilim adamları, genetik verileri kapsamlı bir şekilde analiz etmek için yenilikçi ve güçlü bir DNA sıralama yöntemi olan shotgun metagenomics adlı bir yöntem kullandılar.
Çeşitli, bitki bazlı bir diyetin önemi
İlk olarak, sonuçlar, daha çeşitli bitki bazlı bir diyetin bakteriyel olarak daha çeşitli bir bağırsak oluşturduğunu göstermektedir.
Spesifik olarak, her hafta 30'dan fazla farklı bitki türü tüketenler, haftada yalnızca 10 veya daha az bitki türü tüketenlere göre çok daha çeşitli mikrobiyomlara sahipti.
Ancak araştırmacılar, bu sonuçların, mikrobiyal çeşitliliğin artmasının bir kişinin sağlığı için olumlu bir şey olduğu anlamına gelmediğini belirtiyor.
İkincisi, haftada 30'dan fazla bitki türü yediğini bildiren katılımcılar, antibiyotiklere karşı daha düşük bir direnç gösteriyor gibiydi.
Araştırmacılar, bu insanların dışkı örneklerinde antibiyotik direncini gösteren daha az gen buldular - yani, bakterilerin ilaçlardan kaçmasına yardımcı olan daha az gen.
Çalışma tamamen gözlemsel olsa da ve nedensellik hakkında hiçbir sonuca varamasa da, yazarlar, diyetleri daha az bitki içeren bireylerin, ya antibiyotiklerle tedavi edilmiş olabilen - ya da antibiyotik eklenmiş işlenmiş yiyecekleri yemeyi telafi edebileceğini düşünüyor. .
Bağırsak bakterileri ve akıl sağlığı
Son olarak, çalışma bağırsaktaki bakterilerin bileşimi ile akıl hastalığı arasındaki ilginç bağlantıları ortaya çıkardı.
Travma sonrası stres bozukluğu (TSSB), şizofreni, depresyon veya bipolar bozuklukla yaşadığını bildirenler, yaş, cinsiyet ve vücut kitle indeksi (VKİ) açısından eşleştirilmiş sağlıklı kontrollerle karşılaştırıldı.
Sonuçlar, akıl sağlığı sorunları bildiren kişilerin benzer sorunları bildiren diğer insanlarla kontrollerde olduğundan daha fazla ortak bakteriye sahip olduğunu gösterdi.
Bu ilişki cinsiyet, yaş veya coğrafi konumdan bağımsız olarak güçlüydü. Ayrıca araştırma, depresyonla yaşayan insanlarda bazı bakteri türlerinin daha yaygın olabileceğini öne sürüyor.
Bu bulgular, önceki araştırmalarla zihinsel sağlık ve bağırsak bakterileri arasındaki bağlantıyı güçlendiriyor.
Örneğin, son zamanlarda yapılan bir çalışma, kaygı ile belirli sağlıklı bağırsak mikroplarının yokluğu arasındaki bağlantıyı vurguladı. Bir diğeri, TSSB'li kişilerde belirli bakterilerin değiştiğini buldu.
"Mikrobiyom GPS" e doğru
UC San Diego Tıp Fakültesi'ndeki Amerikan Bağırsak Projesi'nin bilimsel direktörü olan Daniel McDonald, bulguların önemini değerlendiriyor. Diyor:
"Önceki küçük çalışmalardan çok daha fazla mikrobiyal çeşitlilik gözlemledik ve bu, daha fazla popülasyona bakarsak, insan mikrobiyomunun sınırlarını tanımlamak için önemli olan daha fazla çeşitlilik göreceğimizi gösteriyor."
Knight, "İnsan mikrobiyomu karmaşıktır, ancak ne kadar çok örnek alırsak, mikrobiyomun çeşitli sağlık ve hastalık durumlarıyla ilişkili olduğu birçok yolu o kadar çabuk çözebiliriz."
Knight, "Amerikan Bağırsak Projesi dinamik, dünyanın dört bir yanından gelen örnekler günlük olarak geliyor" diye ekliyor.
"Bu makalede sunulan analiz tek bir anlık görüntüyü temsil ediyor, ancak sonunda mikrobiyom haritalarını yapmanın ötesine geçip, size yalnızca haritada nerede olduğunuzu değil, nereye gitmek istediğinizi ve ne yapmanız gerektiğini de söyleyen bir mikrobiyom GPS'i yapmak istiyoruz oraya diyet, yaşam tarzı veya ilaçlar açısından ulaşmak için yapın. "
Rob Knight, Ph.D.
